Le cytoplasme est délimité par la membrane plasmique. Il renferme : le cytosol (milieu semi liquide dans lequel baignent les organites), le cytosquelette (réseau fibreux) et différentes inclusions : réticulum endoplasmique, appareil de Golgi, mitochondries et chloroplastes, lysosomes, peroxysomes, ribosomes, vacuoles… 
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Le noyau contient une partie du patrimoine génétique
Le noyau des cellules eucaryotes est entouré d’une enveloppe nucléaire percée de pores permettant le transport de substances entre le noyau et le cytoplasme. Il contient un ou plusieurs nucléoles et un amas diffus de chromosomes appelé chromatine. Les centrioles sont des organites cylindriques et creux, de 0,2 microns de largeur et de 0,4 microns de longueur. Ils jouent un rôle important dans la division cellulaire. Discrets dans les cellules animales, ils sont généralement absents des cellules végétales sauf chez les végétaux inférieurs : Fougères et plantes alliées, Cycas et Ginkgo. 
Le noyau est le siège du patrimoine génétique, il contient en effet plus de 95% de l’ADN cellulaire, le reste étant situé dans les chloroplastes et les mitochondries. Ces deux organites sont considérés comme des bactéries endosymbiotiques.
La paroi cellulaire
Dans la cellule végétale, la membrane plasmique est entourée d’une épaisse paroi cellulaire rigide qui soutient la forme de la cellule. La paroi cellulaire n’existe que chez les végétaux. Chez les animaux, les cellules cessent d’être fonctionnelles à leur mort. Chez les végétaux, certaines cellules meurent à la fin de leur différenciation (leur spécialisation fonctionnelle)mais la paroi végétale subsiste et continue à assurer ses fonctions, par exemple de conduction de sève ou de soutien.
La membrane plasmique
Toutes les cellules (procaryotes et eucaryotes) sont séparées de leur milieu par une membrane plasmique : elle est l’enveloppe de la cellule. Elle détermine ce qui entre dans la cellule et ce qui en sort. Comme toutes les membranes biologiques, la membrane plasmique a une perméabilité sélective : elle laisse passer certaines substances plus facilement que d’autres. Elle est constituée d’une double couche lipidique, dans laquelle sont insérées des protéines.
Les peroxysomes
Les peroxysomes sont des organites des cellules eucaryotes qui contiennent un mélange d’enzymes assurant des fonctions métaboliques telles que d’oxydation des acides gras en utilisant de l’oxygène moléculaire.